基本信息：

　　型号：IMARIS

　　厂家：英国牛津科技有限公司

　　现安装地点：微生物所所级公共技术中心

　　状态 良好 对外服务 使用时间：周一至周五

　　所内收费标准： 50元/小时

　　所外收费标准：100元/小时

　　仪器使用联系人：张晓兰

　　电话：64806180

　　邮箱：zhangxl@im.ac.cn

　　Imaris是一款多维图像渲染及交互分析软件，具备展示、分割、分析及演绎等所有3D/4D显微图像渲染所必须的功能。从对大数据的三维重构与可视化，对复杂生物结构的智能检测与空间定位，到对神经元、微丝微管、血管的精确重构，提供了多种常规软件无法得到的详实准确的数据，帮助研究者们对图像中细胞群体内复杂的组分关系和结构关系进行定量，在精细细节层次展示生物学过程及结构的变化。在细胞功能学、神经科学、血管生物学、病理学、发育学等多学科领域得到了广泛应用，能够辅助科研工作者更好的进行科学探索和研究。

　　软件功能模块：

　　① 多维图像渲染 Imaris

　　？ 可对多维数据进行Normalize，Smooth，Background Subtraction等前处理;

　　？ 提供MIP, Blend, Normal Shading, Shadow Projection以及Advanced Blend 五种多维渲染模式;

　　？ 可添加slicer，clipping plane等多种展示模式;

　　？ 可输出图片或任意剪切的视频格式;

　　？ 支持TB级别的数据渲染与展示。

　　② 多维图像测量MeasurementPro模块

　　？ 可任意测量多维图像中的空间距离，角度，荧光强度分布等;

　　？ 可自动或手动检测图像信号，并得到相应的空间坐标，强度信息，形态学信息等数据，并可导出为excel;

　　？ 所有数据都可以用于原始数据的分类，排序或筛选;

　　？ 支持TB级别的数据分析。

　　③对象动态追踪与分析Imaris Track Lineage模块

　　？ 可对多个对象同时跟踪，显示可视化运动轨迹，轨迹可以与任何3D渲染目标结合在一起，形成多维可视化图像;

　　？ 自动或手动获得多种轨迹追踪的实验数据，包括持续时间、位移、速度、加速度等，可显示与时间相关的大小，荧光强度等各种参数变化情况，还可根据所有参数，进行分类，排序和筛选，并导出所有的数据;

　　？ 提供Brownian Motion，Autoregressive Motion，Connected Components，Lineage等6种算法，用于各类数据的自动轨迹追踪和分析;

　　？ 可自定义坐标系，校准时间序列成像过程中样本发生的位移，旋转等，并能得到校准后的所有数据结果;

　　？ 针对发育及细胞谱系研究，可自动获得细胞分裂的相关数据并展示和标记分裂的动态过程。

　　④丝状结构的示踪分析FilamentTracer模块;

　　？ 可渲染和展示神经结构，以及与神经结构类似的分支状结构，如血管，细架，植物气孔等;

　　？ 可得到长度，直径，角度，分支节点数，分支结构(如树突，树突棘)的数量，密度等，并根据所有参数，进行分类，排序和筛选，以及导出所有的数据;

　　？ 提供手动、半自动和全自动等多种计算方式;

　　？ 并拥有全新的 Touch功能，辅助超大数据的渲染和计算;

　　？ 结合 TrackLineage，可得到分支状结构的生长速度，生长密度等数据。

　　⑤细胞间结构分析Imaris Cell模块;

　　？ 检测细胞和细胞内细胞成分之间的关系;

　　？ 提供4种不同算法，用于自动识别多维图像中的单个细胞及其亚结构;

　　？ 使用具有生物学意义的图像分析单元(细胞、细胞核和囊泡);

　　？ 基于细胞质或细胞膜染色检测细胞;

　　？ 检测和分类多种囊泡状物体;

　　？ 在2D到4D数据集中检测细胞的行为;

　　？ 测量涉及细胞间通讯的细胞机械和结构功能;

　　？ 自动输出单个细胞数据，并包含细胞及亚结构的关联数据。

　　⑥分离、可视化和量化共定位区域Imaris Coloc模块;

　　？ 支持4维的共定位分析，可输出共定位结果并得到Pearson`s coefficient，Mander`s coefficient等国际通用的共定位参数;

　　？ 提供两种共定位算法，用于弥散或边界清晰的荧光信号分析。

　　⑦可整合导入自编算法的Imaris XT模块;

　　？ 允许使用多种编程语言如Matlab？, Java？ , Python？等，对Imaris进行二次开发;

　　？ 已整合超过70种插件(包括三方开发插件)，提供更加智能和全面的数据处理和分析。

　　⑧多维结果展示与组间分析Imaris Vantage模块;

　　？ 可进行从1维到5维的数据展示和组间数据分析;

　　？ 为数据创建强大的视觉展示效果，同时有助于更好地理解复杂数据;

　　？ 准确识别趋势和异常数据;

　　？ 在视图中自由添加注释;

　　？ 提供T-test等一维数据的组间检验参数。

　　⑨批处理Imaris Batch模块;

　　？ 可自动批量前处理和分析图像;

　　？ 所有批处理的进程都可在后台运行;

　　？ 持多线程批处理运行，最多支持4个独立进程同时进行;

　　？ 机器学习分类无缝整合到工作流程中。