本研究组主持完成及在研的主要科研项目： 

　　1．国家自然科学基金面上项目“极端嗜盐嗜碱古菌遗传操作系统的构建”  （2003-2005) 

　　2．国家“863”项目“海洋嗜盐古菌基因克隆表达系统的构建” (2002-2005) 

　　3．中科院重要方向项目子课题“高温细菌遗传相关蛋白互作组及功能基因研究”(2002-2005) 

　　4．国家自然科学基金面上项目 “极端嗜盐古菌蛋白类抗生素C8生物合成及作用机制”(2006-2008) 

　　5．国家“973”项目子课题“极端嗜盐古菌遗传及环境适应机制的研究”(2004-2009) 

　　6．国家自然科学基金面上项目“极端嗜盐古菌染色体外因子复制机制的研究” (2007-2009) 

　　7．国家863项目“海洋嗜盐古菌功能物质利用的遗传工程技术”(2006-2012) 

　　8．国家自然科学基金重点项目“嗜盐古菌聚羟基脂肪酸酯生理代谢及调控机制” (2009-2012) 

　　9.  国家杰出青年科学基金 “极端嗜盐古菌遗传与生理代谢研究” (2010-2013) 

　　10．中国科学院重要方向项目子课题“嗜盐菌PHA合成关键基础与技术研究” (2011-2013) 

　　11．国家自然科学基金青年项目“极端嗜盐古菌乙酰CoA羧化酶在PHBV合成过程中的作用”( 2011-2013) 

　　12．国家自然科学基金青年项目“极端嗜盐古菌多复制起始位点的利用机制”（2012-2014） 

　　13．国家自然科学基金面上项目“嗜盐古菌CRISPR/Cas系统与基因组稳定性机制” （2013-2016） 

　　14.  国家重点实验室重要方向项目“极端古菌遗传基础及重要生理机制研究”（2013-2015） 

　　15.  国家自然科学基金青年项目“极端嗜盐古菌盐胁迫相关非编码RNA的鉴定和调控机制研究” （2014-2016) 

　　16.  国家自然科学基金面上项目“单体可控的新型短链PHA的古菌合成及材料性能分析”（2014-2017) 

　　17.  国家自然科学基金重点项目“极端嗜盐古菌固碳贮碳及其代谢新途径研究”(2014-2018) 

　　18.  国家自然科学基金面上项目“I-B型CRISPR-Cas系统引发适应的分子机制”（2016-2019） 

　　19.  国家自然科学基金重大研究计划“碳酸盐型盐湖氮硫元素循环的微生物驱动机制及适应机制”（2018-2021）   

　　20.  国家自然科学基金面上项目“CRISPR-Cas与一种新型毒素-抗毒素系统的偶联机制研究“（2018-2021）  

　　21  中科院战略先导专项A  “新型基因组编辑工具及高通量编辑技术” （2019-2024） 

　　22  国家重点研发计划“ 极端微生物底盘细胞设计与构建” （2020-2025）